English | 中文版 | 手机版 企业登录 | 个人登录 | 邮件订阅
厂商 仪器 试剂 服务 新闻 文章 视频 高级搜索
当前位置 > 技术服务 > 生物研发服务> 测序/合成 > MIRNA芯片服务
MIRNA芯片服务
MIRNA芯片服务
安捷伦科技有限公司作为国际领先的生物芯片制造企业,利用其先进的芯片生产工艺,开发出具有独特设计的miRNA检测芯片,能特异性地检测出成熟的miRNA并能很好地区分高度同源的miRNA 分子。
服务类别:测序/合成总访问:471
最后更新:2019-1-18半年访问:125
参考报价:
立即询价 电话咨询
[发表评论] [本类其他服务] [本类其他服务商] [收藏此其他服务]
服务商: 上海鲸舟基因科技有限公司 查看该公司所有服务 >>
  • 服务介绍
  • 公司简介
 
一、Agilent Human miRNA芯片
安捷伦科技有限公司(Agilent Technologies Inc.)作为国际领先的生物芯片制造企业,利用其先进的芯片生产工艺,开发出具有独特设计的miRNA检测芯片,能特异性地检测出成熟的miRNA并能很好地区分高度同源的miRNA 分子。该平台还具有特异性高、灵敏度高等特点。可以广泛地应用于检测和比较各类样品的miRNA表达状态,并通过分析其调控的靶基因来深入分析其调控机制或生物学功能。
Agilent表达谱芯片特点

     ²  通过特殊的探针设计区分成熟miRNA和miRNA前体的芯片平台;
 
  • 无需分离miRNA,直接用Total RNA 进行实验,只需100ng的Total RNA 即可用来进行标记实验(不包括质检所消耗的量),避免了分离、富集、放大等过程带来的影响;
  • 样品适用范围广:组织、血清、血浆、FFPE、冰冻切片组织、脱落细胞等均可进行实验;
  • 高特异性:特殊的专利探针设计能区别一个碱基的差异;
  • 高灵敏度:检测丰度跨4个log,高可达6个log,只要存在6000个拷贝的分子就可以检出;
  • 数据来源于miRBase 21.0版本,并方便及时更新;
  • 人、大鼠、小鼠之外的动物物种,可以方便的通过earray进行个性化定制。
Agilent miRNA芯片类型及参数
blob.png
Agilent表达谱芯片数据分析
blob.png
 
基础分析
数据质控 1.各样本的箱线图
2.各样本的聚类图
3.样本相关性图
4.  PCA图
差异筛选 1.标准化后的microRNA总表
2.差异microRNA列表
3.差异microRNA散点图
4.差异microRNA火山图
5.差异microRNA聚类热图
功能注释 1.差异microRNA的靶基因注释
2.  靶基因的GO富集
3.靶基因的KEGG富集
高级分析
1. 差异microRNA与lncRNA关系预测
2. 差异microRNA与circRNA关系预测
3. 差异microRNA与转录因子关系预测
4.差异microRNA与靶基因的网络图
5.差异microRNA与表达谱数据共表达计算
6. 差异microRNA相关的ceRNA网络图
7. 其它高级分析内容
Agilent表达谱芯片数据分析展示blob.png
 
blob.png
 
  1. miRNA靶基因预测
    microRNA结合在靶基因的3’UTR,下调靶基因。miRNA靶基因预测有多种方法。我们主要利用TargetScan数据库关联microRNA的靶基因。
  1. iRNA与靶基因网络图
    blob.png
                     miRNA与靶基因网络图             
  2. miRNAGO Network 
miR-GO Network利用靶基因的功能注释与microRNA-mRNA靶向调控关系,构建microRNA功能调控的网络图。网络图可发现MicroRNA调控的多种基因功能,并通过网络分析,得到核心调控microRNA以及microRNA调控的核心基因功能。
blob.png
miRNA-GO Network
7.miRNA-Pathway Network 
miR- Pathway Network与miR-GO Network类似.利用靶基因的Pathway间相互作用关系,与microRNA-mRNA靶向调控关系,构建miR- Pathway调控的网络图。网络图可发现MicroRNA调控的多种信号通路,并通过网络分析,得到核心调控microRNA以及microRNA调控的核心信号通路。
blob.png
miRNA-Pathway Network
 
  • 为了研究miRNA的调控机制,首先预测miRNA的promoter区域,根据miRNA的promoter区域,利用HMM来预测结合的转录因子。
  • 9.miRNA与表达谱芯片平台的联合分析
miRNA与表达谱芯片平台的联合分析除了和甲基化与表达谱芯片分析类似外,还可以将miRNA预测的靶基因和表达谱芯片的差异基因取交集,进行miRNA-DiffGene-Network。
blob.png
miRNA-DiffGene-Network
二、中科普瑞基因芯片服务平台
高标准 — 拥有15年以上科技服务实验和分析技术经验的团队成员以GLP-like质量管理体系为您的基因芯片服务体系全线保驾护航。
高效率 — 样品质检合格后,15个工作日出具结果报告,专属生物信息和技术支持服务人员为您提供在线结果咨询和解释服务。
高质量 — 符合3大基因芯片厂商质量要求的服务质量体系,项目质量管理专员负责对您的项目全程跟踪和质控。


blob.png
bio-equip.com
售后服务
快速询价登录注册在线询价 (请留下您的联系方式,以便供应商联系您)
* 姓  名:
* 地  区:
* 单  位:
职  位:
* 手机/电话:
* E-mail:
请寄产品资料:
需要 不需要
请报价格:
需要报价 不需要报价
留  言:
验证码:
换一张
发表评论在线评论(0条)
您最近浏览过的服务
Copyright(C) 1998-2019 生物器材网 电话:021-64166852;13621656896 E-mail:
澳门百家乐网络